运价比较高
由于航空货运的技术要求高、运输成本大等原因，使得它的运价相对来说比较高。所以价值比较低、时间要求不严格的货物，通常在考虑运输成本问题的基础上，而选择其他运输方式
载量有限
由于飞机本身的容积及设计的装载重量限制，对大件货物或大批量货物的运输造成了一定的影响
易受天气影响
航空运输受天气影响非常大，如遇到大雨、大风、大雾等恶劣天气，航班就不能得到有效的保证，就会引发航空货物运输不正常的情况
航空货运单的填开责任
托运人有责任填制航空货运单。托运人对货运单所填各项内容的正确性、完备性负责。由于货运单所填内容不准确、不完全，致使承运人或其他人遭受损失，托运人负有责任。根据《中华人民共和国民用航空法》第113条和第114条规定，托运人应当填写航空货运单正本一式三份，连同货物交给承运人。航空货运单不符合规定或航空货运单遗失，不影响运输合同的存在或者有效。
航空货运单的限制
一张货运单只能用于一个托运人在同一时间、同一地点托运的由承运人承运的，运往同一目的站同一收货人的一件或多件货物。任何IATA成员都不允许印制可以转让的航空货运单，货运单上的“不可转让”字样不可被删去或篡改。
5.交付货物时收货人异议的提出
1.货物的明显损坏，应在发现损坏时立即提出，迟在收到货物后14天内提出； 2.货物的其他损坏，自收到货物之日起14天内提出； 3.货物延误，自其自由支配货物之日起21天内提出； 4.货物没有交付，自填开货运单之日起120天内提出。
诉讼应在货物到达目的地之日起，或从飞机应该到达之日当日起，或从运输停止之日起两年内提出，否则即丧失承运人诉讼的权利。
航空货运违禁品
1. 各种武器、仿真武器、弹药和爆炸物品；
2. 伪造的货币及伪造有价证券；
3. 对中国政治、经济、文化、道德有害的印刷品、胶卷、照片、唱片、影片、录音带、录像带、激光视盘、计算机存储介质及其它物品；
4. 各种烈性毒药；
精神；
7.有碍人畜健康的，来自疫区的以及其它能传播疾病的食品、药品或其它物品。