三格式化粪池是由三个相互连通的密封粪池组成，粪便由进粪管进入池依此顺流至第三池，其各池的主要原理：
池
主要截留含虫卵较多的粪便，粪便经发酵分解，松散的粪块因发酵膨胀而浮升，比重大的下沉，因而形成上浮的粪皮、中层的粪液和下沉的粪渣。利用寄生虫的比重大于粪尿混合液的原理使其自然沉降于化粪池底部。利用粪液的浸泡和翻动化解粪块使其液化并截留粪渣于池底。厌氧发酵：化粪池的密闭厌氧环境，可以分解蛋白性有机物，并产生氨等物质，这些物质具有杀灭寄生虫卵及病菌的作用。
第二池
起进一步发酵、沉淀作用，与池相比，第二池的粪皮和粪渣的数量减少，因此发酵分解的程度较低，由于没有新粪便的进入，粪液处于比较静止状态，这有利于漂浮在粪池中的虫卵继续下沉。
第三池
主要起储存粪液的作用。经前二格处理的粪液进入第三池，基本上已经不含寄生虫卵和病原微生物，达到了粪便无害化要求，可以供农田直接施肥。
清理化粪池作业程序：1.用铁钩打开化粪池的盖板，再用长竹杆(8m)搅散化粪池内杂物结块层。
2.把吸粪车开到工作现场，套好吸粪胶管(5m长，备3条)放入化粪池内。
3.启动吸粪车的开关，吸出粪便直至化粪池内的化粪结块物吸完为止，防止弄脏工作现场和过往行人的衣物。
4.盖好化粪池井盖，用清水冲洗工作现场和所有工具。
5.每年清理一次，一级池清运90%，二级池清运75%，三级池硬的表面全部清运。
6.化粪池清理后，目视井内无积物浮于上面，出入口畅通，保持污水不溢出地面。
7.在化粪池井盖打开后10～15min，人不站在池边，禁止在池边点火或吸烟，以防沼气着火人。
8.人勿下池工作，防止人员中毒或陷入水中。
9.化粪池井盖打开后工作员不能离开现场，清洁完毕后，随手盖好井盖，以防行人掉入井内发生意外。
清理化粪池作业人员规范：1、组织工作人员进入工作区域，熟悉工作现场，划分作业区域，进行现场作业培训与可发生性事故警告，按照公司施工保障制订一带五制度（由一名员负责监督五名作业人员作业）。
2、作业人员作业前须进行入场登记才准进入作业区域（未带帽，未穿防护服，未穿防滑鞋，未配带施工证），落实所有技术措施和人身防护用品，未经落实时不得进行施工。
3、作业人员应做到文明施工、自护、爱岗敬业、尽职尽责、不怕艰苦、乐于奉献、服从管理、听从指挥、不断提高业务技能。
化粪池工作原理：
通常设计为三格化粪池，新鲜粪便由厕所管道进入池，池内粪便产生沼气开始发酵分解，因比重不同粪便可分为三层，上层为比较浓的粪渣垃圾，下层为块状或颗粒状粪渣，中层为比较清的粪液。在上层粪便和下层粪渣中含和寄生虫卵多，中层含虫卵少，初步发酵的中层粪液经过化粪管流到第二格池，第二格池内再化酵分解沉淀后溢流到第三格，第三格池再经过沉淀过滤后清水流到下水管道。